Equipements

LSR II™ (Becton-Dickinson - Cytomètre-analyseur)

Le LSRII™ est équipé de 3 LASER à alignement fixe, séparés spatialement. L’émission de fluorescence est collectée jusqu’aux détecteurs de type octogone et trigone. Cette configuration permet l’analyse simultanée de 11 paramètres de fluorescence. L’électronique digitale permet une meilleure résolution des signaux et augmente considérablement la sensibilité de détection. Ces deux aspects permettent une haute vitesse d’acquisition sans perte de qualité (30 000 évènements maximum par seconde). C’est également la possibilité de réaliser les compensations automatiques, en temps réel ou en différé.

Le pilotage de la station et l’acquisition des données sont réalisés avec le logiciel BD FACSDiva 6.1.2.

 

LASER PMT Dichroïc Filtre   Désignation
Diva
Fluorochrome commun
Liste non exhaustive
488 nm A 755 dLP 780 / 60 BP 750 - 810 PE - Cy7 PeCy7
22 mW B 685 dLP 695 / 40 BP 675 - 715 PerCP - Cy5.5, PerCP, PE-Cy5.5, Draq 5
  C 655 dLP 660 / 20 BP 650 - 670 PE - Cy5 7-AAD
  D 600 dLP 610 / 20 BP 600 - 620 PE - Texas Red IP
  E 550 dLP 575 / 26 BP 562 - 588 PE Pyronine Y
  F 505 dLP 530 / 30 BP 515 - 545 FITC Alexa 488, GFP, YFP, Zombie
Green, JC-1 (monomere),
SYTOX Green, TO-PRO-1
  G   488 / 10 BP 483 - 493 SSC SSC
633 nm A 755 dLP 780 / 60 BP 750 - 810 APC - Cy7 APC - Cy7, Zombie NIR
17 mW B 710 dLP 730 / 45 BP 707 - 750 Alexa Fluor 700 Cy5.5
  C   660 / 20 BP 650 - 670 APC Alexa 633, Alexa 647, Cy5, TO - PRO - 3
355 nm A 505 dLP 530 / 30 BP 515 - 545 Indo-1 (bleu) Indo-1 (bleu)
20 mW B   450 / 30 BP 435 - 465 Indo-1 (violet) DAPI, Hoechst, Pacific Blue
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Le pilotage de la station et l’acquisition des données sont réalisés avec le logiciel BD FACSDiva 6.1.2.

 

LASER PMT Dichroïc Filtre   Désignation
Diva
Fluorochrome commun
Liste non exhaustive
488 nm A 755 dLP 780 / 60 BP 750 - 810 PE - Cy7 PeCy7
22 mW B 685 dLP 695 / 40 BP 675 - 715 PerCP - Cy5.5, PerCP, PE-Cy5.5, Draq 5
  C 655 dLP 660 / 20 BP 650 - 670 PE - Cy5 7-AAD
  D 600 dLP 610 / 20 BP 600 - 620 PE - Texas Red IP
  E 550 dLP 575 / 26 BP 562 - 588 PE Pyronine Y
  F 505 dLP 530 / 30 BP 515 - 545 FITC Alexa 488, GFP, YFP, Zombie
Green, JC-1 (monomere),
SYTOX Green, TO-PRO-1
  G   488 / 10 BP 483 - 493 SSC SSC
633 nm A 755 dLP 780 / 60 BP 750 - 810 APC - Cy7 APC - Cy7, Zombie NIR
17 mW B 710 dLP 730 / 45 BP 707 - 750 Alexa Fluor 700 Cy5.5
  C   660 / 20 BP 650 - 670 APC Alexa 633, Alexa 647, Cy5, TO - PRO - 3
355 nm A 505 dLP 530 / 30 BP 515 - 545 Indo-1 (bleu) Indo-1 (bleu)
20 mW B   450 / 30 BP 435 - 465 Indo-1 (violet) DAPI, Hoechst, Pacific Blue
Gallios (Beckman-Coulter - Cytomètre-analyseur)

Le Gallios est équipé de 3 LASER à alignement fixe, séparés spatialement. Le banc optique de type boulevard permet une transmission de la fluorescence proche de 100% avec ses filtres de réflexion positionnés à 18°. Il permet de mesurer jusqu’à 10 paramètres de fluorescence. La cellule d’écoulement en quartz est couplée au moyen d’un gel à des lentilles de collection d’ouverture numérique de 1,2. Il est possible d’adapter l’angle de collection de la lumière diffractée à la taille des éléments analysés grâce à 2 photodiodes indépendantes. Il est ainsi possible de distinguer entre elles des particules submicrométriques (0,4 er 0,5 µm). L’enregistrement des données sur 20 bits permet des compensations de haute précision. Le passeur de tube de type carrousel permet d’analyser automatiquement jusqu’à 32 tubes. Avant chaque analyse l’échantillon est remis en suspension au moyen d’un vortex incorporé. La vitesse d’acquisition maximale est de 25 000 évènements par seconde et jusqu’à 24.106 évènements stockés par fichier (ce chiffre varie en fonction du nombre de paramètres sauvegardés).

Le pilotage de la station et l’acquisition des données sont réalisés avec le logiciel Kaluza G.

 

LASER PMT Dichroïc Filtre   Désignation
standard
Fluorochrome commun
Liste non exhaustive
488 nm Filtre 1 550 dSP 525 / 40 BP 505 - 545 FITC Alexa 488, GFP, YFP, Zombie
Green, JC-1 (monomere),
Sytox Green, TO-PRO-1
22 mW Filtre 2 595 dSP 575 / 30 BP 560 - 590 PE PE, Alexa 546, DiOC,
DyeCycle Orange, SNARF
  Filtre 3 655 dSP 620 / 30 BP 605 - 635 PE-Texas Red PE-Texas Red, PI, DiOC
  Filtre 4 730 dSP 695 / 30 BP 680 - 710 PE - Cy5.5 PE-Cy5.5, PerCP-Cy5.5, Alexa
700, Tri-Color, 7-AAD,
  Filtre 5   755 LP   PE - Cy7 Alexa 750
638 nm Filtre 6 710 dSP 660 / 20 BP 650 - 670 APC Alexa 647, Cy5, TO-PRO-3,
Sytox Red
25 mW Filtre 7 750 dSP 725 / 20 BP 715 - 735 Alexa 700 Alexa 700
  Filtre 8   755 LP 755 LP APC - Cy7, APC-Alexa 750, APC-H7
405 nm Filtre 9 480 dSP 450 / 40 BP 430 - 470 Pacific Blue Alexa 405, PO-PRO-1,
DyeCycle Violet
40 mW Filtre 10   550 / 40 BP 530 - 570 SYTOX blue AmCyan


d : Dichroïque – LP : Long Pass – SP : Short Pass - BP : Band Pass

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Le pilotage de la station et l’acquisition des données sont réalisés avec le logiciel Kaluza G.

 

LASER PMT Dichroïc Filtre   Désignation
standard
Fluorochrome commun
Liste non exhaustive
488 nm Filtre 1 550 dSP 525 / 40 BP 505 - 545 FITC Alexa 488, GFP, YFP, Zombie
Green, JC-1 (monomere),
Sytox Green, TO-PRO-1
22 mW Filtre 2 595 dSP 575 / 30 BP 560 - 590 PE PE, Alexa 546, DiOC,
DyeCycle Orange, SNARF
  Filtre 3 655 dSP 620 / 30 BP 605 - 635 PE-Texas Red PE-Texas Red, PI, DiOC
  Filtre 4 730 dSP 695 / 30 BP 680 - 710 PE - Cy5.5 PE-Cy5.5, PerCP-Cy5.5, Alexa
700, Tri-Color, 7-AAD,
  Filtre 5   755 LP   PE - Cy7 Alexa 750
638 nm Filtre 6 710 dSP 660 / 20 BP 650 - 670 APC Alexa 647, Cy5, TO-PRO-3,
Sytox Red
25 mW Filtre 7 750 dSP 725 / 20 BP 715 - 735 Alexa 700 Alexa 700
  Filtre 8   755 LP 755 LP APC - Cy7, APC-Alexa 750, APC-H7
405 nm Filtre 9 480 dSP 450 / 40 BP 430 - 470 Pacific Blue Alexa 405, PO-PRO-1,
DyeCycle Violet
40 mW Filtre 10   550 / 40 BP 530 - 570 SYTOX blue AmCyan


d : Dichroïque – LP : Long Pass – SP : Short Pass - BP : Band Pass

MoFlo Astrios (Beckman-Coulter Cytomètre-trieur)

Le MoFlo Astrios est un trieur haut de gamme ultra-rapide. Il est équipé de 5 LASER fibrés (hormis le LASER U.V.) et décalés spatialement. Les émissions de fluorescences sont collectées par des fibres optiques placées en sortie de pinhole. La configuration du banc optique de type « precision Optical Device » permet de mesurer jusqu’à 16 paramètres de fluorescence. De conception « jet in air » l’Astrios peut atteindre une vitesse de tri de 70 000 évènements par seconde.
Les performances du système sont remarquables tant au niveau de la qualité de rendement et de pureté, de la vitesse d’acquisition et de tri, que de la capacité du traitement et du stockage des signaux.
Les signaux sont digitalisés à une fréquence de 100 MHz sur 32 bits (jusqu’à 100 000 évènements par seconde en analyse). En mode logarithmique, la gamme dynamique de mesure des signaux s’étend sur 5 décades (0,0001 à 10 volts). Il est possible d’activer simultanément 6 jets de tris, soit de trier six populations, selon des mode définis individuellement (single cell, pureté, enrichissement et mixte).

Le système est équipé d’un module de clonage.
Les supports de tube pour l’échantillon sont multiples et il est possible de programmer son agitation.
La récupération des fractions triées dans des plaques multi-puits, sur des lames ou dans différents types de tubes s’effectue grâce à un bras robot. L’échantillon et les fractions collectées peuvent être maintenus dans un environnement où la température est régulée. Un jeu de buses de diamètre variable (50 à 200 µm) permet d’adapter le tri à la taille des évènements à analyser.

Le pilotage du trieur et l’acquisition des données sont réalisés avec le logiciel Summit 6.2.

 

Sources d’excitation 355 nm
Sources d’excitation 405 nm
Sources d’excitation 488 nm
Sources d’excitation 561 nm
Sources d’excitation 640 nm

 

Filtres
supplémentaires
  Designation standard Fluorochrome commun
Liste non exhaustive
405 / 10 BP 400 - 410    
513 / 26 BP 500 - 526 FITC  
530 / 10 BP 525 - 535    
561 / 14 BP 563 - 569    
592 / 08 BP 584 - 596    
642 / 10 BP 637 - 647    


d : Dichroïque – LP : Long Pass – SP : Short Pass - BP : Band Pass

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Le système est équipé d’un module de clonage.
Les supports de tube pour l’échantillon sont multiples et il est possible de programmer son agitation.
La récupération des fractions triées dans des plaques multi-puits, sur des lames ou dans différents types de tubes s’effectue grâce à un bras robot. L’échantillon et les fractions collectées peuvent être maintenus dans un environnement où la température est régulée. Un jeu de buses de diamètre variable (50 à 200 µm) permet d’adapter le tri à la taille des évènements à analyser.

Le pilotage du trieur et l’acquisition des données sont réalisés avec le logiciel Summit 6.2.

 

Sources d’excitation 355 nm
Sources d’excitation 405 nm
Sources d’excitation 488 nm
Sources d’excitation 561 nm
Sources d’excitation 640 nm

 

Filtres
supplémentaires
  Designation standard Fluorochrome commun
Liste non exhaustive
405 / 10 BP 400 - 410    
513 / 26 BP 500 - 526 FITC  
530 / 10 BP 525 - 535    
561 / 14 BP 563 - 569    
592 / 08 BP 584 - 596    
642 / 10 BP 637 - 647    


d : Dichroïque – LP : Long Pass – SP : Short Pass - BP : Band Pass

Laboratoire de culture

Le laboratoire de culture mis à votre disposition est constitué d'un PSM, d'un incubateur à CO2 et d'un évier. Le service possède un réfrigérateur/ congélateur, une centrifugeuse réfrigérée et une microfuge réfrigérée. Une machine à glace est accessible à proximité.

Ces équipements sont utilisables pour entreposer mommentanément du matériel biologique ou autre. Ce matériel devra être clairement identifié.


 

 

 

Station d'analyse

La station d'analyse du service est accessible gratuitement sur réservation LORA.

Les logiciels disponibles, d'analyse des données de cytométrie, sont :

Venturi One Version 6

FlowJo Version 10

Summit Version 6

Kaluza 1.3

Le logiciel de déconvolution des phases du cycle cellulaire : Modift version 3.3 est disponible sur l'ordinateur du cytomètre - analyseur LSRII. Contacter le service pour y avoir accès.